小智一行人在途中遇到的一曲迷失方向的七夕青鸟想要去帮助他们的时候，他们与保育家，日向再一次重逢。
日向成功将他们恢复正常之后，代欧奇希斯出现在了众人的面前。
“等一下，这只代欧奇希斯传来的气息有点不一样，好像很混乱的感觉。”
‘好冷，好可怕，只有我一个人，没有亲人，没有等待到的人’。
众人都搞不懂这只宝可梦突然出现想干什么，但是小智好像通过波导感应到了某种画面。
寄宿在陨石之内的这只和另一个个体，在十年前到达了地球，可即使到达地球后，他们被火箭队的人抓捕，后来他逃走了之后，那个组织为了寻回自己，用自己的同伴做诱饵，但是却被自己的血亲的攻击，随后被抓捕，后来他被用来和自己的血亲对抗，最后火箭队阴谋被瓦解了，而他也以这里作为据点，独自去寻找离开的同伴，但最近不知道为什么，总是经常性的絮乱，感到很痛苦。
代欧奇希斯此时好像也可以感知到小智那种理解自己的能力，甚至还自己还感觉到他的身体里流淌着相同的血，于是忽的一下消散在虚无的空间中，还把小智卷了进来
小智因为确实想知道这只代欧奇希斯的问题，所以没有反抗，任由他掳走了自己，但是皮卡丘他们却着急了，和伊布一起冲到小智身边，抓住了他的脚后跟，一起被代欧奇希斯走了，只剩下小遥他们待在原地不知所措，只能决定先到宝可梦中心再作打算了。
被掳走的小智他们，被带路一个像是小孩子房间的白色虚无空间，面前代欧奇希斯也出现在了小智面前似乎想要与他交流。
“你看起来很痛苦的样子，能和我讲讲你到目前为止的经历吗，说不定我们能帮你呢”，小智看到代欧奇希斯出现，便问道。
‘△▲▲△’，代欧奇希斯用了一些连皮卡丘这些宝可梦都不懂的语言开始和小智他们交流，但是还好，小智虽然同样听不懂这些东西的意思，但是他还是能理解代欧奇希斯的内心所想。
“原来如此，一直到这个地方之后你就没有一刻安心过，经常会有种难受的感觉是吗？”
此时来到宝可梦中心的莎莉娜等人遇到了一个出乎意料的人。
“赤红...叔叔！”莎莉娜一进入宝可梦中心就看见了那个身穿红衣，戴着红帽子，面容和小智有着八分神似的人。
“你是莎莉娜吧？小智怎么没跟你在一起？”赤红也发现了莎莉娜，他们于是走了过来问道。
莎莉娜简单的叙述了一下情况
“原来如此，你们碰到他了，我也一直在找他，你们知道他在什么地方吗？”赤红说道
“那个莎莉娜，他是谁呀？你好像认识他。”小遥这时问道
“你们好！我的名字是赤红，小智的父亲，你们就是和小智一起旅行的同伴吧！”赤红说道
“诶，小智的父亲！”小遥，小胜和日向都很吃惊，尤其是小遥，她好像有点儿慌乱。
另一边的山洞中
代欧奇希斯带着小智来到了这颗陨石的所在地，但是小智，发现这颗陨石处于不稳定的状态，似乎是要爆炸。
这个时候，赤红带着日向和莎莉娜他们也赶来了，代欧奇希斯看见了赤红之后就察觉到了，她就是当年的那个训练家，刚想要上前和他说话，但是因为陨石而失控暴走。
“爸爸...现在要怎么办？”小智问道
“小智，你去阻挡住代欧奇希斯其他的人去阻止陨石的爆炸，就让我见识一下，你有没有资格挑战我。”赤红说道
于是小智放出了蜥蜴王去阻挡，日向他们想办法去阻止陨石的爆炸，而赤红则是以旁观者的身份看着。
“一开始就全力以赴的上吧，硬化植物”
‘○’，但是受到硬化植物影响的代欧奇希斯似乎并没有手上，在巨藤中打出一道圆形的能量，直接冲破了那些巨藤，朝着因为硬直不能行动的蜥蜴王而来。
‘jiu！’，蜥蜴王借助一根此时才升起的硬化植物的巨藤将他甩了去出去，躲过了来自对方的攻击，之后在空中终于挨过了硬直时间，这是蜥蜴王自己想出来的办法之一
“叶刃！”
恢复行动能力的蜥蜴王展开了双手的刀刃，朝着代欧奇希斯的方向连续挥舞，切开了一个个阻碍，或是用刀叶偏离对方的攻击，终于接近了目标，正准备一刀砍下
‘●’，就在蜥蜴王手起刀落的那一刻，代欧奇希斯将身体缩成一个球体，周围环绕着透明色的圆形防护罩，弹开了蜥蜴王的攻击
‘✶’，瞬间，代欧奇希斯有变化为攻击表示，使出名为精神增压的招式，蕴含着强大力量的球形能量体朝着蜥蜴王发射了过去
“找到落脚点之后，继续使用刀叶”，被弹开的蜥蜴王，顺势用尾巴击打了一处峭壁，然后调整好身体姿态，再次借力起跳，跃过了代欧奇希斯的攻击，又一次拔出了他的两手利刃
‘↑’，忽然这次，代欧奇希斯有转化为速度模式，从蜥蜴王身边咻的一下冲刺，避开了刀叶
“追上去，别让他走的太远了”，蜥蜴王也加速奔跑，并且利用自己的跳跃能力更进一步接近对方，最后靠着一处跳跃，终于骑到了代欧奇希斯身上
“再来一次，硬化植物”
蜥蜴王这次在代欧奇西斯身边开始发力，周围各种巨大的藤条从地面迅速上升，将代欧奇希斯包围在其中，然后互相交织在一起，击打在代欧奇希斯身上
‘✶’，它再一次变化为攻击模式，发出招式将硬化植物的藤条一瞬之间全部湮灭，不过他时不时会停下动作，给了蜥蜴王这边很多的进攻机会
“蜥蜴王，再来一次刀叶”，骑在代欧奇希斯深身上的蜥蜴这次准备近身挥砍了，但是此时，他身下的这家伙眼神看上去变清澈了许多
‘停手，蜥蜴王’，感知到代欧奇希斯已经恢复正常了，小智立马喊停
‘jiu…’，蜥蜴王从代欧奇西斯身上跳了下来，有点意犹未尽的感觉，看着对面也没了战意的代欧奇希斯有些遗憾，毕竟自己还没正式打败这家伙呢，而且之前的战斗自己也一直处于偏下风的位置。
之后他们成功阻止了陨石的危机，日向成功捕获代欧奇希斯让它恢复了正常。
“一切都结束了，好久不见了，代欧奇希斯！对了，你应该再找他吧。”赤红说着放出了另一只代欧奇希斯。
“滴滴...滴！”这只代欧奇希斯出来就看到了自己的同伴，于是很高兴，在过了十年的时间，终于又再一次重逢的。
“爸爸，这到底是怎么回事儿？这只代欧奇希斯，是陨石事件那个时候的那只！”小智问道
“没错，准确的说，刚才和你对战的那只，可以说是我的兄弟。”赤红说道。
“这到底是怎么一回事啊，爸爸？”小智问道
于是赤红开始讲述了十年前的事。
十年前，一颗名叫古兰的陨石，坠落在丰缘大陆上，当时赤红受大木博士所托前来调查，可是那块陨石却被火箭队劫走了。
后来火箭队在那个陨石中发现了这两只代欧奇希斯，前者为个体一，后者为个体二，进行研究。
后来赤红想要阻止火箭队的研究，但是一个不察，坂木得到了自己的血液，将其融入这只代欧奇希斯，后来他便暴走离开了那里。
后来坂木为了将它重新找回，派个体一去袭击了小蓝的父母，后来自己在与个体一的战斗中，把他引了过来。
后来这两只都被火箭队捕获，不过个体一在战斗中失去了能力，所以便被遗弃。
后来他暂时被坂木所利用，来和自己对抗，不过最后它还是摆脱了控制，最后他们一起，阻止了火箭队的阴谋。
一切结束之后，代欧奇希斯消除了关于他们的记忆，而后它为了寻找被抛弃的同伴，一个人到处旅行。
“这就是一切的答案，不久前这只个体二找到了我，之后我便和他一起开始寻找着个体一。
我打听到这里有带有代欧奇希斯的目击报告，所以过来看看，刚好遇见了莎莉娜他们！”赤红说道
“原来是这么一回事啊，那接下来怎么办？”小智问道
“代欧奇希斯，要不要和你的同伴跟我一起成为我们的家人吧！”赤红说道
“滴滴”代欧奇希斯二话不说就点头答应了，毕竟自己的同伴已经找到了，而自己也不想再忍受独自一人的那种孤独，所以他没有做出反对。
“那么今后就请多指教了，兄弟。”赤红举起拳头，代欧奇希斯也学着举起了拳头碰拳。
“可是，代欧奇希斯不是四年前才被发现的吗？如果在十年前就已经存在了，那为什么那个时候就没有说出来呢？”小胜不解
“因为当时，火箭队秘密的封锁了消息，后来的那场大战中，代欧奇希斯也消除了他们的记忆，所以唯一还记得的就只有我了。”小智说道
“原来如此！”
在一切结束之后，那两只代欧奇希斯就跟着赤红返回了真新镇，想去也将自己的两只代欧奇西斯交给赤红带回去，而日向也完成了任务，返回了巡护员联盟。
再告别之后，小智一行人然后边向着最后的一个对战设施，对战金字塔前进。