百岱市，据说曾经这里是个遗迹，有许多稀世珍宝早已被挖掘，其中，最珍贵的，就属传说中的金刚宝珠了。
金刚宝珠，据说蕴含着时间之神帝牙卢卡的力量，可以召唤帝牙卢卡出现，但是到目前为止，研究员们都不清楚这东西到底该怎么用。
而金刚宝珠，就放在百代市的博物馆里面。
这不，三人正好经过这里，小光对那所谓的.金刚宝珠很感兴趣，就打算进博物馆看看，至于小智和莎莉娜，对宝珠什么的根本不感兴趣，因为自己以前见过帝牙卢卡，来博物馆也只是陪小光而已。
不过，主角毕竟躲不了走到哪事件发生到哪里的诅咒，三人才刚进入博物馆，博物馆就发生了盗窃案。
君莎小姐带领一群警卫将博物馆封锁起来，盗贼还在博物馆里面，根据目击者说似乎还有一只向日花怪做搭档。
“请问，君莎小姐，发生什么事情了？”三人才刚进来，就发现了一群警察，有些好奇。
“你是？小智搜查官？”君莎小姐先是向小智敬了个礼，“博物馆没的金刚宝珠被盗走了，有目击者声称罪犯是使用向日花怪的人。”
“你说向日花怪？！实在是太不像话了！竟然使用草系宝可梦进行犯罪！太过分了！绝对不可原谅！”一名穿着绿斗篷，黄色的裤子的橙色短发女子十分愤怒地说道。
“菜种馆主，请你不要妨碍我们。”君莎小姐看着菜种说道。
“不行！这次的犯人竟然使用草系宝可梦犯罪！我绝对不会原来他们的！一定要把他们抓住！”菜种背后燃起火焰了。
“菜种馆主，好久不见了”小智对菜种说道。
菜种：“啊！小智先生？没想到你已经来这里了！可惜现在很明显不是接受挑战的时候，我要抓住那个用向日花怪犯罪的犯人！”
“队长！我们抓到了一个嫌疑人！”一帮警察拉着一个双手被拷住的一脸平淡的男子过来。
“诶？！尚志先生？！”小光非常惊讶的看着被拷住的人，正是有过一面之缘的流浪诗人尚志先生。
“呀～各位，好久不见了～”尚志先生微笑着说道。
“哎呀！你不就是昨天的挑战者吗？”菜种认出了尚志。
“是的，承蒙你的关照。”尚志说道。
“尚志先生，能告诉我们这是什么情况啊？”小智来到尚志先生面前问道。他是不相信尚志先生是凶手的，从尚志先生的表情就能看得出来，他一副完全悠闲的配合这帮警察，就已经证明他不是犯人了，真要是犯人，此刻被抓住就不会是这副表情。
“事情要从之前讲起～我和我的向日花怪在博物馆里参观，将思绪放飞到悠久地历史之中，可惜突然警铃大作，然后就被警卫们围起来了，说我和向日花怪是窃贼嫌疑人，我就束手就擒配合警卫可惜向日花怪似乎受到惊吓了逃跑了，之后的事，就是这样了～”尚志先生用非常押韵的音律说道。
“不要再唱了！我看是你让它逃跑的吧金刚宝珠一定在那个向日花怪身上吧？”君莎小姐很是严厉的对着尚志说道。
“君莎小姐，我可以担保尚志先生绝对不是什么坏人，而且你见过哪个束手就擒的盗贼会像尚志先生这样的？”小智对君莎小姐说道。
“这……”君莎小姐愣住了。
“呐，还有，你给握看的那个证据。”小智拿出那个照片，照片上面确实有一只向日花怪拿着金刚宝珠，这是监控拍到的。
“这可不是向日花怪！君莎警官，你该不会，是刚上任的警官吧？”小智严肃的看着君莎小姐。
“这，我确实是刚上任不久的，小智搜查官真的很聪明呢。”君莎小姐说道。
“我严重怀疑你得了眼疾，这么严重的问题，你都没有发现！你见过哪只向日花怪长有喵喵金币还有虎牙？还有更重要的，你们就没有发现这是用布料做的吗？缝线还有胶带都这么明显了！你们到现在都没有发现吗！”小智指着照片上的三大疑点质问着君莎小姐。
“我……”君莎小姐又一次哑口无言。
“办事不利，还冤枉人，这可不是个好警官，见习警官小姐，你还有好多东西要学的。”小智淡淡地说道。
“谨遵教诲！”君莎小姐夜意识到了自己还是太年轻了，年轻气盛的认为自己做的一定就是对的，但是好多遗漏的线索她完全忽略掉了，这根本不是个好警官该干的。
“另外，皮卡丘，对通风口使用十万伏特！”小智看了眼天花板地通风口说道。
“皮卡！丘！”皮卡丘照做，跳起来一发十万伏特击中通风口内的某三人组。
“啊啊啊！”三人组从通风口掉了下来。
熟悉地武藏、小次郎，还有打扮成向日花怪的喵喵！
“是火箭队！”小光说道。
“你们就是犯人吗？”菜种生气的看着三人组。
“哈～真是可恶！失败了呢！啧！放弃任务吧！”武藏十分果断的说道。
三人组如今已经是见好就收的人了，不会像以前那样因为一些东西就拼个你死我活的人了。尤其是小智还在的情况！
“还给你们喵！”喵喵直接将金刚宝珠丢出去。
三人组赶忙丢出个烟雾弹，直接开溜。
“别想跑！”君莎想追上去，但是烟雾已经笼罩整个博物馆了。
“回来，不必追了，他们想要逃跑的话，是根本抓不住他们的。
“好快，在全是烟雾的情况下竟然还能跑掉！”君莎小姐惊讶道。
“重要的是宝珠没问题就行。”小智看了看被沙奈朵用念力控在空中的宝珠。
小智用手接过了宝珠，金刚宝珠突然微微一闪，速度非常快，而且很不明显，几乎没有人注意到。
……
“小智大人……”沉睡中的，帝牙卢卡，微微睁开了眼睛。
这一睁开不要紧，一下子就看见了闯进它的地盘的帕鲁奇亚。
“好你个帕鲁奇亚！胆敢闯入我的领地！说好的互不侵犯的！你竟然公然违反！看我不收拾你！”
……
“嗯？帝牙卢卡？它怎么会跑到我的地盘了？奇怪？居然还朝我杀过来了？！”帕鲁奇亚本安安静静地翱翔在自己的空间，却发现帝牙卢卡竟然怒气冲冲的朝着自己冲来了！一上来就给自己来了一发时空咆哮！
帕鲁奇亚一惊，赶忙使出亚空切裂将时空咆哮击溃，“吼！帝牙卢卡你想干什么！！”
“吼！少废话！你竟敢入侵我的底地盘！说好的互不侵犯的呢？”帝牙卢卡怒吼道。
“你说什么？这里是我的地盘！”帕鲁奇亚眉头一皱说道。
“呵！还干嘴硬！找打！”帝牙卢卡再次冲上来。
“你别给我得寸进尺！”帕鲁奇亚火气也上来了，真就和帝牙卢卡大打出手，丝毫没有在意周围地空间逐渐扭曲了。
而时空的扭曲，间接影响到了安静待在反转世界的那个从不在现界露脸的冥王龙，骑拉帝纳的生活。
“那两个家伙在搞什么？为什么突然就打起来了？！”骑拉帝纳睁开红目，看着扭曲的反转世界，从这里可以看到那两个疯了的双龙正在内讧。
“反转世界有点不稳，不过，还在我的控制之内，呵！先找事的是帝牙卢卡对吧？等以后有机会一定找你算账……”骑拉帝纳闭上眼睛继续休养生息。
这个时候，骑拉帝纳头顶时空扭曲，一个巨大的石头掉下来，当场砸中了头顶。
骑拉帝纳：“吼！可恶的帝牙卢卡！！！我跟你没完！”
黑暗区域
“时空产生扭曲了，哈哈哈！又越多越好，越多越好。扭曲的越多多，我的力量恢复得就越快。”
白岱市一座高楼内
“镇星大人，他们失败了。”一个绿头发，的男子在蓝发男子面前说道。
“本来还以为他们能有多厉害。算了，全体撤退舍弃这个分部，等待下一次的机会。”
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