在一个美好的清晨，小诺一行人从空梦市乘着列车来到了蔚墨镇。在蔚墨镇，有着三个柯诺地区的标志性地点——蔚墨镇道馆、化石博物馆还有野生原野区。野生原野区，官方的名称叫做“狩猎地带”，是大多数地区都拥有的设施，而设立野生原野区的地方，一般都会是宝可梦种类最丰富的自然保护区，这一次的蔚墨镇，正拥有着柯诺地区最大的自然保护区。而化石博物馆，则是存放着稀有的化石的重要地方，有一些化石，可以通过特殊的方式复活成为远古时期的化石宝可梦，这对宝可梦培育家来说，是一个很好的参观机会。
凯多决定前往化石博物馆去一睹化石们的风采，而琪琪也表示要同去，诺菲丝犹豫了一下，最终还是同凯多和琪琪一起前往了化石博物馆，毕竟，学习参观的机会，错过了可就没有了。
不过小诺却非常不喜欢博物馆这种建筑，在他眼里，博物馆就是一个死气沉沉的地方，毫无生气，于是小诺便准备在宝可梦中心的后院为了接下来的道馆战做了对战特训，夜薰则表示要陪着小诺，自从那天以后，夜薰总是特别喜欢跟在小诺的身旁，虽然是没有意识的事情，但两人总是形影不离。
凯多和琪琪、诺菲丝来到化石博物馆以后，发现化石博物馆的负责人金佑博士正要进行一项实验，出于好奇，两人便凑了上去。
“您好，金佑博士，久仰大名，请问你们现在在做什么研究诶？”凯多问道。
那个被称之为金佑博士的中年人打量起了凯多和琪琪，便回复道：“我们正在做化石复活的实验，话说你们俩是宝可梦训练家吧。”
凯多点了点头：“是的，我叫做凯多，不过我们刚刚出道不久，并且，我的训练家类型是培育家，而琪琪倒是一名对战训练家能。”
“哈哈，没关系，有兴趣看看化石宝可梦？”金佑博士热情地邀请了他们。于是，凯多和琪琪欣然答应了，跟随着工作人员来到了实验室参观。
另一边，小诺在宝可梦中心的对战场地上，准备开始进行训练，他打开精灵球，放出了耿鬼。
“嘎嘎，大早上的叫老夫出来干嘛啊？”耿鬼看上去一副刚睡醒的样子。
小诺拿出进化钥石，来到了耿鬼的面前：“耿鬼，我们再来试一下上一次你所释放出来的幽灵之王的力量吧，我想好好地研究一下这股力量”
“拉倒吧你。”耿鬼无情地给小诺泼了一盆冷水：“你以为幽灵之王的力量说用就能用啊。”
“为什么就不能用呢？”小诺嘴上虽然这么问，但心里已经猜出了个大概，只是想知道详细的原因，毕竟，了解每一个宝可梦的身体状况，可是宝可梦训练家的必修课。耿鬼上一次使用完这股力量，可是休息了好一段时间呢，这段时间的训练，耿鬼都没有参加。
“现在的老夫，严格来说，还不算是真正的幽灵属性宝可王，这种力量，很长一段时间才能够使用一次，而且使用以后，会有虚弱期，在这个期间，战斗力会大打折扣，不过正常的超级进化倒是可以。”耿鬼将这股力量的相关信息，一五一十地都告诉了小诺：“等到老夫真正地完成了属于自己的封王，才能肆意妄为地使用力量，并且发挥它的全部，上一次使用出来的，只是这股力量的一点皮毛罢了。”
“也是啊，我不能太过依赖你的力量了。”小诺不禁感慨。
“雪笠怪、岩儡、翼舞燕、灵炎，它们四个资质都很不错，早日让它们完成最终的进化，或许它们将会给你带来不一样的惊喜也说不定。”耿鬼飘到了一旁：“不得不说，你的宝可梦们都非常有意思。”
小诺点了点头，对耿鬼的说法表示赞同，按下精灵球的开关派出了所有的宝可梦，并且宣布了特训的内容：“灵炎，你可以试着巩固一下妖精属性的招式了，翼舞燕，你的飞行速度已经足够快，但招式的熟练度还要加强，岩儡和雪笠怪，你们两个进行模拟对战！路卡利欧还有皮卡丘，你们同样继续进行招式巩固提升。”
“皮卡~丘！”皮卡丘对着路卡利欧跃跃欲试了起来。但路卡利欧似乎看上去并没有什么训练欲望的样子，不过还是和皮卡丘开始了训练，而其他宝可梦们都表示很愿意接受训练，于是，一阶段的训练就这么开始了。
另一边，在化石博物馆，凯多和琪琪还有诺菲丝亲眼在实验室见证了化石宝可梦的复活，被复活的宝可梦是一只巨大的龙形态宝可梦，它的身体是灰色的，而翅膀上有一部分地方是紫色的，爪子有四个。
“是化石翼龙啊。”凯多认出了这只宝可梦。
“哇，看上去好酷的样子啊。”琪琪看着还没有睁开眼睛的化石翼龙，不禁有一些心动。要是能收服它就好了。
“据说，化石翼龙是复活不完全的产物，有些学者认为超级进化后的化石翼龙才是古代时期真正的样貌呢。”诺菲丝科普道。
“原来是这样啊，小丝你真的是移动的知识库呢。”琪琪对着诺菲丝夸道。诺菲丝只是笑了笑，没有继续发言。
可是，就在这个时候，意外发生了，化石翼龙睁开眼睛，看到眼前的众人，它突然变得愤怒起来，只见它飞到了半空中摆出了战斗姿态。幸亏复活的地点是一个密闭的空房间，要不然可是要出大乱子的。
“是想和我战斗吗？”凯多似乎明白了化石翼龙的意思。
化石翼龙冲着凯多大吼了一声。
“好，我明白了，那么几天就和你战个痛快吧！”只见他拿出精灵球，按下开关之后，一只蓝鳄出现在了化石翼龙的眼前。
“化石翼龙是岩石和飞行系的，使用水属性的宝可梦来同它对战它比较有优势。”金佑博士不由地称赞道：“不愧是一名宝可梦训练家呢。”