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惨烈的芝加哥大战，博派虽然成功击退了狂派的入侵，却也让地球人对他们失去了应有的信任与尊重。由美国中情局组建的墓风部队对所有的变形金刚进行无差别的猎杀，一时间博派和狂派全都在地球不见了踪影。
某天，居住在得州的落魄机械发明家凯德·伊格买回来一辆破旧的卡车车头，谁知那竟是处在休眠中的博派首领擎天柱。嗅到气息的墓风部队蜂拥而至，苏醒后的擎天柱救走了凯德一家，也和散落在各个角落的博派相继取得联系。另一方面，疯狂的人类科学家从变形金刚的残骸中获知了他们变形的秘密，并企图借此制造出人造金刚，而脱胎自威震天的惊破天正是他们的得意作品以及催命死神。新一轮的危机卷土而来，地球面临更大的灾难。
发明家凯德·伊格尔帮助博派，他在一个垃圾场看管着一群幸存的博派。与此同时，擎天柱回到自己的母星赛博坦，发现曾经的家园已经面目全非，创造擎天柱的女神昆塔莎指示他，只有将地球的力量吸入赛博坦，母星赛博坦才有可能存活。受到黑化的擎天柱回到地球，誓死与地球为敌，要毁灭地球。拯救世界的责任落在了由凯德为首的非同寻常的队伍身上，大黄蜂、英国爵士、牛津大学教授，一场史诗浩劫彻底将地球变成了战场